人都催促处理其事，朝臣没有不叹息的。
大将军何进、太尉袁隗、司徒杨赐联名向皇帝上书，说：“人君内视反听，则忠臣就竭诚以事；宽待贤者，夸耀他的才能，义士就更加严格要求自己。所以孝文皇帝采纳了冯唐的意见，晋悼公原宥了魏绛的罪过。王允是按特选任用的。他诛除叛逆，抚慰归顺，不到一个月，豫州境内扫清。正要列举他的功勋，报请朝廷加爵赏赐，却因奉事不当，应处极刑。责斥轻，处罚重，有失众望。臣等位在宰相，不敢默不作声。臣等实在认为王允应该蒙三槐之听讼，以明忠贞之心。”
于是，王允被判为减死罪一等。
这年冬天，又逢朝廷大赦，唯独王允不在赦免之列。
三公要员继续上书替王允主持公道。等到第二年，王允才被免罪释放。
当时，朝中宦官当权，张让阉党凭借权势横行霸道，偶有小怨小忿，都会被他们害死。王允担心会遭宦官迫害，只得改名换姓，离开都城洛阳，辗转于河内、陈留之间。