因吏治衰败而渐渐无用，高务实就任户部尚书之后便令重建各地常平仓及义仓平衡谷价，此次再遇灾荒，他便先发义仓，义仓不足再发常平，以此不必全部依赖向朝廷求赈。
高务实来河南时已调拨国库三十万两库平银，又带了五十万两明联储纸钞，并留漕粮十万担用于赈济。于是通告各地废止高价卖米禁令，以聚集商品米便于官府操纵。但时间一长之后也渐渐不足。
时至次月，给事中禄中立上疏《论罢太和山织造疏》抨击朱翊钧漠视灾荒，应停止太和山织造，省下经费救灾。朱翊钧不应，继续征收太和山香税及行织造以供皇帝私用及宫廷祭祀颁赏之用。
高务实也不同意此疏论点，在他看来这织造开着好歹能解决部分人就业呢，真裁撤了对河南当地又无多少裨益，因此作为赈灾经略，也没上疏赞同。
意外的是灾情相对稳定之后，徇私舞弊现象又有发生，部分官员利用灾民不知钱粮减免开支用度，使诈受贿，欺上瞒下。高务实得知果然震怒，一边将应上缴官府的税收明细及减免钱粮明细全部公开，专门雇人派往各地宣讲，令世人皆知。一边严加督查，抑制贪弊，以防再次发生。
而与此同时，他果真用上了王命旗牌，将第一批涉案官员不分轻重全部处斩，一次杀了二十七人，所有人头直接挂在经略行辕门口。一颗颗狰狞首级承托出高阁老的杀气腾腾，河南官场一时静如死寂。
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